丁明跃，男，博士，华中科技大学生物医学工程系主任、教授，博士生导师，图像信息处理与智能控制教育部重点实验室副主任，华中科技大学-迪正雅合医学影像联合实验室主任，兼任IEEE高级会员，SPIE会员，中国生物医学工程学会高级会员，《电子学报》《宇航学报》编委，中国医疗器械技术创新联盟专家委员会委员，湖北省生物医学工程学会生物医学仪器专业委员会副主任委员，中国生物医药生物技术协会生物医学信息分会常务委员。承担完成国家自然科学基金，国家高技术863，国家教委跨世纪优秀人才基金，教委博士点专项基金，国防科工委基金，航天基金以及加拿大研究项目等四十余项，其中目前承担与本项目相关的课题八项。已编辑出版英文论文集、中英文专著(章节)八部，在国内外权威期刊以及国际会议上发表论文300余篇。

1.1什么是生物医学工程？
按照生物医学工程（Biomedical Engineering，BME）类教学质量国家标准，生物医学工程是运用工程学的原理和方法解决生物医学问题，提高人类健康水平的综合学科。它是一门由理、工、医相结合的交叉融合而形成的学科,是多种工程学科向生物医学渗透的产物。具体来说，她运用现代自然科学和工程技术的原理、技术与方法,从工程学的角度,在多层次上研究包括人体等生物体的结构、功能及其相互关系,揭示其生命现象,为防病、治病以及生命科学研究提供新的技术手段的一门综合性、高技术的学科。它涉及到生物、医学以及工程学的各个领域，包括材料、物理、计算机、电子信息、图像处理、机械、光学等。因此，不同学科与专业领域的高度综合与多学科交叉融合是生物医学工程学科*大的特点，也是与其他工科专业不同之所在。
按照上述定义，以往我们接受的关于生物医学工程的定义是: “应用工程学原理和方法来解决生物学和医学的问题” 。但是，美国Drexel大学生物医学工程— 科学与卫生系统学院教授，美国医学与生物工程国际联合会 (IFMBE)主席，曾任美国国立卫生研究院 ( NIH)生物医学工程研究部门主管的Dov Jaron教授就认为这一定义太窄了。 他给出新的定义是: 生物工程学结合物理学、化学或数学和工程学原理，从事生物学、医学、行为学或卫生学的研究；提出基本概念 ,产生从分子水平到器官水平的知识，开发创新的生物学制品、材料、加工方法、植入物、器械和信息学方法 , 用于疾病预防、诊断和治疗，病人康复，改善卫生状况等目的。
生物医学工程的世界五彩缤纷，研究领域非常广泛的。不仅包括了医学影像、生物力学等传统研究领域，也包含了神经工程、生物纳米技术等学科领域与方向。它的发展对临床医学做出了巨大贡献！得到了世界上越来越多国家的重视。例如日本在2006年启动的the AIST (National Institute of Advanced Industrial Science and Technology) 第二阶段计划中就把清晰地把聚焦有关人的科学与技术发展将成为未来科学与技术发展的主流。欧洲也将其列入了欧盟地平线2020计划和健康2020计划。
许多有识之士认为，在新世纪随着自然科学的不断发展,生物医学工程的发展前景不可估量，因为它的发展具有很强的行业背景与产业需求。其中，医疗器械产业就是生物医学工程学科存在*为重要、*大的行业背景与产业需求。医疗器械产业肩负着为医学临床提供所需要的医疗设备、材料与软件等重任，是医院赖以生存与发展的重要物质基础，也是大健康产业的重要支柱，对于大健康产业的发展和提升我国的技术和经济水平具有举足轻重的地位与影响，被国家列为“健康中国2030”规划纲要和“中国制造2025”提升计划等国家战略发展的重点。建立生物医学工程专业的一个重要目的就是为引领我国以及世界医疗器械产业的学科发展，理论开拓以及技术进步，为医疗器械企业培养合格的高技术人才，从而促进产业，尤其是我国医疗器械产业，的发展，满足人们日益增长的健康需求。

目录
第一章 生物医学工程简介 1
1.1什么是生物医学工程？ 1
1.2为什么要开设生物医学工程概论课程？ 3
1.3国际生物医学工程发展概况 8
1.4国内生物医学工程发展现状 9
1.5 我国医疗器械产业发展现状 10
1.6生物医学工程领域主要研究方向 14
1.6.1医学影像 14
1.6.2 生物材料及其制品 18
1.6.3 组织工程 20
1.6.4 生物力学 23
1.6.5 生理信号无创检测——数字化机体(个体化)功能状态动态连续监测系统 24
1.7 生物医学工程未来的主要发展领域 26
1.7.1 生物阻抗成像 27
1.7.2 激光生物医学 30
1.7.3 生物传感器 32
1.7.4 微电机系统-微米、纳米技术 36
1.7.5 介入诊疗技术 39
1.7.6 医用机器人技术 41
1.7.7 医学人工智能技术 47
1.8 本章小结 55
思考题 55
参考文献 56
第二章 生物信息学概论 58
2.1 生物信息学的定义 58
2.2 生物信息学的发展历程 61
2.3 中国生物信息学发展的历程 67
2.4 生物信息学的研究内容及一般研究方法 70
2.5 如何成为*生物信息学家？ 73
2.6 生物信息学的发展现状、前景和挑战 76
思考题 80
参考文献 81
第三章 生物医学传感器 84
3.1 简介 84
3.1.1 传感器分类 85
3.1.2 传感器的封装 86
3.1.3 传感器特性 86
3.2 生物电位测量 96
3.2.1 电解质/金属电极界面 97
3.2.2 心电电极 98
3.2.3 肌电电极 99
3.2.4 脑电电极 99
3.2.5 微电极 100
3.3 物理指标测量 101
3.3.1 位移传感器 101
3.3.2 气流传感器 109
3.3.3 温度检测 109
3.4 血液气体传感器 113
3.4.1 氧气测量 113
3.4.2 pH电极 117
3.4.3 二氧化碳传感器 118
3.5 生物传感器 118
3.5.1 电化学葡萄糖传感器 119
3.5.2 电化学乳酸传感器 122
3.6 光学传感器 122
3.6.1 光纤 122
3.6.2 光纤pO2传感器 123
3.6.3 光纤pH传感器 124
3.6.4 光纤pCO2传感器 125
3.6.5光纤压力传感器 125
3.6.6光纤温度传感器 126
3.6.7光纤免疫荧光传感器 126
3.7 本章小结 127
思考题： 127
参考文献： 128
第四章 面向系统生物医学的下一代测量技术 129
4.1背景 129
4.2系统生物学与系统生物医学 129
4.3下一代测量技术 129
4.4 组学分析技术 129
4.5 展望 129
第五章 生物大数据的统计分析与深度学习 130
5.1生物统计学基础 130
5.2传统生物统计学及其应用 131
5.2.1生物统计量的计算和表征及其应用 131
5.2.2生物数据的中常见的几种分布及其应用 132
5.2.3生物数据的分组和比较及其应用 136
5.2.4针对生物数据的假设检验及其应用 136
5.2.5 假设检验 136
5.3生物大数据与概率统计模型 138
5.3.1 Hidden Markov Model (HMM)及其应用 139
5.3.2 进化树的概率模型 142
5.3.3 Motif finding中的概率模型 145
5.3.4 基因表达数据分析 147
5.3.5 基因网络推断与分析 148
5.3.6 Dimension reduction及其应用 149
5.4 面向生物大数据挖掘的深度学习 151
5.4.1 深度学习方法的类型 152
5.4.2 深度学习 153
5.4.3 深度学习应用于生物大数据分析 155
5.5本章小结 157
思考题 157
参考文献 159
第六章 生物材料与组织工程 161
6.1基本概念 161
6.1.1生物材料及其衍生医疗器械产品 161
6.1.2组织工程的出现及其发展 164
6.2 典型生物材料产品 165
6.2.1 心血管类 165
6.2.2 骨科及外科 167
6.2.3 齿科 170
6.2.4 眼科 171
6.2.5 其他 171
6.3 如何研发生物材料产品 172
6.3.1从实验室到临床应用的路径 172
6.3.2生物材料产品的伦理学问题 174
6.4 新型生物材料及相关技术 174
6.4.1 3D生物打印 174
6.4.2 介入治疗与生物材料 175
6.4.3 组织工程与再生医学 175
思考题 177
参考文献 177
第七章 医学超声与超声断层成像 178
7.1医学超声成像 178
7.1.1医学超声简介 178
7.1.2现代超声成像技术 179
7.2 超声断层成像现状 179
7.2.1什么是超声断层成像 179
7.2.2国际发展现状 181
7.2.3国内发展现状 185
7.3超声断层成像重建方法 187
7.3.1反射成像 187
7.3.2声速、衰减成像 189
参考文献 191
第八章 三维超声成像与应用 194
8.1 什么是三维超声？ 194
8.1.1 二维超声存在的问题 194
8.1.2 什么是三维超声成像技术？ 194
8.2 三维超声的发展历史 195
8.3 三维超声成像技术的分类 196
8.3.1 基于机械扫描的三维超声成像 196
8.3.2 自由臂三维超声成像 201
8.3.3 基于三维探头的三维超声成像 204
8.4 三维超声重建误差分析 219
8.4.1 平行扫描重建误差分析 220
8.4.2 偏转扫描重建误差分析 222
8.5 三维超声图像显示 223
8.5.1 面绘制 224
8.5.2 多平面显示 224
8.5.3 体绘制（volume rendering） 226
8.5.4 立体显示（stereo view） 228
8.6 三维超声的临床应用 229
8.6.1 胎儿缺陷检测 229
8.6.2 心血管疾病的诊断与治疗 230
8.6.3 前列腺近放射治疗（prostate brachytherapy） 232
8.6.4 颈动脉粥样硬化分析91 238
8.6.5 基于三维超声穿刺活检术 242
8.7 本章小结 243
思考题 244
参考文献 245
第九章 正电子发射断层成像 255
9.1 基本概念 255
9.1.1 PET成像及应用意义 255
9.1.2 PET成像中的信息转化 255
9.2 PET成像关键环节 257
9.2.1 正电子到伽马光子 257
9.2.2 伽马光子到可见光 259
9.2.3 可见光到电 262
9.2.4 模拟到数字 263
9.2.5 数据到图像 265
9.3 全数字PET介绍 268
9.3.1 MVT采样方法 268
9.3.2 全数字PET探测器 268
9.3.3 全数字PET系统 269
第十章 质谱成像方法 271
10.1引言 271
10.2质谱成像的原理和方法 271
10.2.1 MADLI-MS质谱成像 272
10.2.2 SIMS质谱成像 275
10.2.3 DESI质谱成像 275
10.2.4 三种质谱成像方法比较 276
10.3 质谱成像技术的应用 277
10.3.1 MALDI质谱成像技术应用 277
10.3.2 SIMS在生物组织成像应用 282
10.3.3 DESI质谱成像应用研究 283
10.4 前景与展望 284
参考文献 285