本书记载九寨沟国家自然保护区中藻类84属228种（含变种变型），其中硅藻55属186种；绿藻11属14种，蓝藻门7属10种；裸藻门1属5种；甲藻门3属3种；轮藻门1属3种；金藻门3属3种；黄藻门1属2种；隐藻门2属2种。硅藻是九寨沟藻类的主要类群，占总种数的80%以上，我们用酸处理的方法对硅藻进行了处理，在油镜下观察鉴定，部分种类浮游活体和扫描电镜照片；非硅藻种类较少，但它们常形成优势群落。